yokaのblog

湖で微生物の研究してます

2019-12-06から1日間の記事一覧

コンティグ・ゲノムへのリードマッピング・カバレッジの計算方法

メタゲノムやメタトランスクリプトームの解析をやっていると、コンティグやゲノムのカバレッジを決めたい場面が多々出てくる。アセンブル前のリードを、アセンブルしたコンティグやゲノムにアライメントして、マッピングされた(貼り付いた)リードの量(正…