yokaのblog

湖で微生物の研究してます

2015-07-28から1日間の記事一覧

USEARCHを使った16S rRNAアンプリコンシーケンス析②

前回よりもさらにマニアックなんだけど、備忘で書いておく。 USEARCHでNGSデータを分析するとき、454のMIDタグ付きのリードファイルであれば、前回の方法でそのまま処理できるんだけど、illuminaのリードの場合は、 ①ペアエンドのリードがそれぞれ別のfastq…